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La Fundación Marcelino Botín colabora con varios centros de investigación del país en sus diversas disciplinas.

El Centro Nacional de Estudios Superiores del Español (CIESE) que promueve la Fundación Comillas en esta localidad, tiene por objeto la promoción y enseñanza especializada del español y de todas las manifestaciones culturales ligadas a esa lengua.
El proyecto Campus Comillas cuenta con el respaldo de las principales instituciones académicas, empresariales y políticas de España, incluida la Casa Real. Tras la simbólica colocación de la primera piedra de las obras de rehabilitación del Seminario Mayor en diciembre de 2007, durante 2008 los trabajos avanzaron a buen ritmo y se espera que a finales de 2009 comience la actividad intensiva en este edificio.
Promoción internacional
2008 ha sido un año fundamental para el Campus Comillas. Se ha potenciado tanto la propia promoción comercial como las visitas institucionales, los patrocinios y la participación en eventos internacionales. Todo ello ha contribuido a reforzar la imagen de marca de la Fundación Comillas en el ámbito internacional.
Así, durante 2008, entre otras actuaciones, ha tenido lugar la presentación institucional de la Fundación Comillas en las embajadas, consulados, universidades y oficinas de turismo de Japón, La Haya, China, Moscú, Londres, Nueva York, Berlín y Estados Unidos.
Asimismo, la Fundación Comillas ha estado presente en ferias en Asia (China Education Expo, ICEF Japón Workshop, ICEF China Workshop), Europa (Alphe Londres, ICEF Berlín Workshop), Rusia (ICEF Moscú Workshop) y América (Salao do Estudiante y Feria del Libro, en Sao Paulo; NAFSA, ACFTL, ICEF Workshop Americas).

El Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares (CNIC) es la institución líder en la investigación cardiovascular en España, una de las áreas prioritarias y de mayor impacto para la población. Culminó 2008 con un balance muy favorable:
• Se celebró el Primer Simposio Cardiovascular Internacional CNIC. Supuso la presentación oficial a la comunidad científica y congregó a ponentes de relevancia internacional durante el 27 y el 28 de junio.
• Continuaron los avances en uno de los proyectos más emblemáticos del Centro: la polipíldora, fármaco para prevenir el infarto. El medicamento está próximo a su fase de ensayos clínicos.
• Se seleccionaron dos nuevos proyectos, coordinados por la Universidad de Gerona y la Fundación Jiménez Díaz. El objetivo es facilitar la conversión del conocimiento generado en los laboratorios de investigación básica en práctica clínica, así como responder a los interrogantes científicos que surgen en los centros asistenciales.
• En materia de transferencia, en 2008, se han presentado 5 nuevas solicitudes, se han realizado 15 comunicaciones de invención y 1 concesión de contrato de licencia.
Además, el CNIC ha iniciado los preparativos para acoger un estudio mundial en riesgo cardiovascular. El programa, denominado Placa de Alto Riesgo (HRP, por sus siglas en inglés), combina pruebas genéticas y de tecnoimagen para identificar a las personas en riesgo de desarrollar una patología cardiovascular. El HRP, que contempla una muestra de 8.000 personas, ya se ha iniciado en Estados Unidos y llegará en 2009 a nuestro país.
Por último, la firma de 42 convenios con instituciones, tanto nacionales como internacionales, refuerza la vocación del CNIC de ser un centro de referencia en materia de colaboración, que actúe como aglutinador de una estructura sólida en la investigación cardiovascular española, al tiempo que fomenta las relaciones internacionales.